"Pharmazeutische Chemie" ist der Bereich der Pharmazie, der sich mit der Erforschung der Chemie von Arzneimitteln befasst. Ein Arzneimittel wird definiert als eine Verbindung, die von Menschen (und in Erweiterung auch von anderen Lebensformen) zu therapeutischen Zwecken eingenommen wird, sei es wörtlich zur Behandlung oder aus präventiven Gründen. Das Arzneimittel durchläuft nach seiner Einführung in den Organismus verschiedene, oft komplexe und mehrstufige Prozesse, die seine Wirkung, Stoffwechselveränderung und letztendlich seine Ausscheidung betreffen. Die bedeutende Entwicklung der Biologie hat uns wichtige Erkenntnisse über die Funktionen des Lebens auf zellulärer und molekularer Ebene geliefert, und dieses Wissen, kombiniert mit Informationen aus der Medizin, hat es in vielen Fällen ermöglicht, den Wirkungsmechanismus von Arzneimitteln zu verstehen. Das Ziel der pharmazeutischen Chemie besteht genau darin, die Informationen aus Biologie und Medizin unter Mitwirkung von Kenntnissen aus Informatik, Chemie, Physik und Mathematik zu nutzen, um eine umfassende Untersuchung der Wirkung des Arzneimittels auf den Organismus zu ermöglichen.