Endlich von Angesicht zu Angesicht mit seinem ultimativen Erzfeind findet Naruto heraus, dass der wahre Schmerz viel mehr ist, als er sich jemals hätte vorstellen können. Als die Folgen der turbulenten Politik der Vergangenheit ans Licht kommen, führt eine unerwartete Wendung der Ereignisse dazu, dass ein neuer Ninja die Macht in Konoha übernimmt. Und die erste Handlung des neuen Anführers wird Narutos Welt für immer verändern.