Shikamarus Team ist auf Rache aus gegen die Mörder ihres Mentors. Tsunade versucht, sie aufzuhalten, aber Kakashi will helfen! Während die Kluft zwischen den Ninjas wächst, setzt die geheimnisvolle Organisation Akatsuki ihren brutalen Angriff auf die tailed spirits, die Biju, und die jungen Ninjas, die sie beherbergen, fort, einschließlich Naruto! Aber Naruto ist älter und stärker, und seine neue Jutsu ist schwieriger zu handhaben, als er dachte. In der Zwischenzeit fällt Sasuke weiter unter Orochimarus Zauber, und nennt sogar seine neue Ninja-Zelle Team Serpent. Während Naruto und die anderen versuchen, Sasuke im Auge zu behalten, gerät ihr lang verlorener Freund in einen erbitterten Kampf mit einem alten Feind. Das Ergebnis könnte die Ninja-Welt, wie Naruto sie kennt, schneller zum Ende bringen, als er es sich je vorgestellt hat!