Das Gleichgewicht des Heiligen Königreichs Keidas steht auf dem Spiel, als mächtige, wilde Kreaturen, bekannt als "Wraiths", von der anderen Seite des Schleiers eindringen und drohen, die Lebenden zu verschlingen. Die Wraiths verderben ihre Opfer und können sogar deren Körper übernehmen, wodurch sie zu unaufhaltsamen Monstern werden, die gewöhnliche Menschen jagen. Die "Chimeras", hybride Krieger, die aus der Vereinigung zweier Seelen geboren wurden, sind die einzigen, die die Menschheit schützen können. 

Briar und Lute sind zwei Schwestern, die als Chimeras wiedergeboren wurden. Die Verwandlung hat Briar übermenschliche Stärke und Widerstandskraft verliehen, während Lute, die sich geopfert hat, um ihre Seele mit der ihrer Schwester zu verbinden, zu einem Geist mit mystischen Kräften geworden ist. Gesprochen von Stefanie Joosten (Metal Gear Solid 5), werden Briar und Lute auf eine Mission geschickt, um eine zerstörte Stadt zurückzuerobern, die von den Wraiths verwüstet wurde, nur um zu entdecken, dass der Orden, dem sie angehören, einen viel komplexeren Plan verfolgt.