Cross Academy wird von zwei Gruppen von Schülern besucht: der Tagesklasse und der Nachtklasse. In der Dämmerung, wenn die Schüler der Tagesklasse zu ihren Schlafsälen zurückkehren, kreuzen sie den Weg der Nachtklasse auf dem Weg zur Schule. Yuki Cross und Zero Kiryu sind die Wächter der Schule und schützen die Tagesklasse vor dem dunklen Geheimnis der Akademie: Die Nachtklasse besteht aus Vampiren!

Yuki Cross hat keine Erinnerung an ihre Vergangenheit vor dem Moment, als sie vor zehn Jahren vor einem Vampirangriff gerettet wurde. Sie wurde vom Schulleiter der Cross Academy adoptiert und arbeitet nun zusammen mit Zero, um das Geheimnis der Akademie zu bewahren. Yuki glaubt daran, dass Vampire und Menschen friedlich zusammenleben können, aber ihr Partner hat andere Vorstellungen...